El principio de funcionamiento es sencillo, la estufa pellets tiene un depósito donde almacena los pellets, cuando la ponemos en funcionamiento, el mecanismo va trasladando los pellets a la cámara de combustión, ordenado por el sistema de control electrónico. Una vez en la cámara de combustión, los pellets se queman emitiendo energía térmica y humos, estos se canalizan a través de una salida trasera donde tendremos conectado una conducto hacia el exterior.
Al hablar de estufas de pellets por aire mucha gente puede confundirlas con las estufas de leña tradicionales, pero existe una diferencia fundamental, las estufas de pellets por aire son ventiladas, lo que quiere decir que mediante un ventilador interno toman aire de la habitación, lo calientan y lo devuelven nuevamente a la habitación.
Existen estufas de pellets por aire adaptadas en dimensiones y peso para ser ubicadas en el pasillo, ahorrando así espacio en otras estancias y calentando una de las zonas donde más paso hay de la casa. Este tipo de estufa de pellet es perfecta tanto para el pasillo como para ubicarla en un estancias de dimensiones reducidas. Como peculiaridad especial de estas estufas de pellets, es que la salida de humo suele estar en la parte de arriba o en el lateral, así evitas una separación de la pared dejando únicamente las canalizaciones que van a las habitaciones que se desean calentar.